La pluie figurait également parmi les protagonistes du warm-up MotoGP™ du Grand Prix Motul du Japon, mais Marc Márquez (Repsol Honda Team) a réussi à inscrire un chrono en 1'56.719. Le Catalan, seul pilote sous la barre des 1'57, devançait son compatriote Aleix Espargaró (Aprilia Racing Team Gresini), lequel confirmait un week-end déjà exemplaire au guidon de son Aprilia RS-GP.
Álex Rins (Team Suzuki Ecstar) terminait pour sa part au troisième rang devant Jorge Lorenzo (Ducati Team), Danilo Petrucci (Octo Pramac Racing) et Andrea Dovizioso (Ducati Team).
Cal Crutchlow (LCR Honda) finissait quant à lui septième devant une autre Suzuki, celle d’Andrea Iannone (Team Suzuki Ecstar), et Kohta Nozane (Monster Yamaha Tech3), remplaçant de Jonas Folger (Monster Yamaha Tech3), souffrant.
Loris Baz (Reale Avintia Racing) se voyait crédité de la 11e position. Le Français était suivi de Valentino Rossi (Movistar Yamaha MotoGP), Sam Lowes (Aprilia Racing Team Gresini) et Johann Zarco (Monster Yamaha Tech3), lequel s’élancera de la pole position pour la deuxième fois de l’année.
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