Auteur du meilleur temps vendredi matin à Sepang, Dani Pedrosa est resté installé au sommet de la hiérarchie suite à une seconde séance qui a eu lieu sur piste mouillée et qui a été dominée par Iván Silva. Casey Stoner et Jorge Lorenzo, qui n'ont, comme Pedrosa, pas participé à la seconde séance, complètent le Top 3 de la journée.