第１７戦マレーシアＧＰのフリー走行１は２８日、セパン・インターナショナル・サーキットで行われ、２０１６年王者のブラッド・ビンダーが今季１７度目のトップタイムをマーク。第１０戦オーストリアＧＰ以来、今季２度目となる週末最初のプラクティスを制した。
気温３０度、路面温度３１度のハーフウェットコンディションの中、前戦オーストラリアＧＰで６勝目を挙げたビンダーは、トラックコンディションの回復を待って走行を開始。１度のコースアウトで７ラップを周回すると、２分１６秒台を１回、２分１５秒台を１回記録。２分１５秒５２０の１番時計を刻んだ。
総合１９位のカイルール・イダム・パウイは、２度のコースインで１０ラップを周回すると、２分１６秒台を２回記録して、０.８５１秒差の２番手。総合７位のフランセスコ・バグナイアは、２度のコースインで１１ラップを周回すると、２分１６秒台を１回記録して、１.０１４秒差の３番手。
総合３０位のマルコス・ラミレス、総合１８位のリビオ・ロイ、総合１３位のアロン・カネト、総合１５位のホルヘ・マルティン、総合５位のジョアン・ミル、総合３位のホルヘ・ナバーロ、総合１４位のファビオ・クアルタラロがトップ１０入り。
総合２３位の尾野弘樹は、１.９２８秒差の１２番手。負傷代役の佐々木歩夢は、３.４３９秒差の２２番手。総合２６位の鈴木竜生は、３.７０１秒差の２６番手だった。
リザルト（www.motogp.com/ja/Results+Statistics/）
Significantly faster than they were at the start of the session, here's the top9️⃣#MalaysianGP pic.twitter.com/YAandmKlSG
— MotoGP™ (@MotoGP) 28 de octubre de 2016