Champion de la Red Bull MotoGP Rookies Cup en 2009, Jakub Kornfeil participe cette même année à ses premiers Grands Prix, puis obtient un guidon chez Racing Team Germany pour 2010. D’emblée le Tchèque inscrit une cinquième place à domicile, avant de migrer chez Ongetta-Centro Seta. Classé douzième de la campagne 2011, lequel prolonge un an de plus avec son équipe et rejoint Redox RW Racing GP en 2013. Ses résultats lui permettent alors d’être recruté par le team Calvo pour la saison 2014. Ce dernier intègre ensuite le team du Sepang International Circuit et s’offre deux podiums. En 2016, le représentant du Drive M7 SIC Racing Team, désormais sur Honda, se hisse à neuf reprises parmi les dix premiers, en plus de cette deuxième place en Malaisie. 2017 marque le début d’un nouveau chapitre pour lui chez Peugeot MC Saxoprint, mais sa saison ne fut ponctuée que de deux Tops 10, si bien qu’il glisse du 8e au 22e rang du classement général. En 2018, il parvient malgré tout à se relancer en figurant régulièrement aux avant-postes. Finalement classé neuvième, il poursuivra avec la même structure cette année.