第９戦チェコＧＰの公式予選は、６月２０日現地時間１０時１０分からアウトモトドローム・ブルノで行われ、初日午後のプラクティスで１番手に進出した小椋藍がフリープラクティス２で１３ラップを周回して５番手だった後、５ラップ目に自身がプラクティスで樹立したオールタイムラップレコード（１分５１秒７３５）を０.５９６秒更新する１分５１秒１３９を記録。
プレミアクラスのデビュー戦となった２０２５年３月の開幕戦タイＧＰで５番手に進出した予選最高位を上回り、プレミアクラス２７戦目で初めてポールポジションを獲得。中量級のタイトルを獲得した２０２４年１０月の第１８戦タイＧＰ以来キャリア通算７度目。
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— MotoGP™🏁 (@MotoGP) June 20, 2026
日本人ライダーとして、２０２０年１０月の第１２戦トゥルエルＧＰで予選最高位に進出した中上貴晶以来２０６４日ぶり。２００２年に始まった『MotoGP™』では同年第１３戦パシフィックＧＰの加藤大治郎、２０２４年第１１戦ポルトガルＧＰ、第１２戦日本ＧＰ、最終戦バレンシアＧＰの玉田誠に続き４人目。
年間の予選最速者を決定する『BMW M AWARD』で２５ポイントを加算して総合１１位から８位に再浮上した。
ファビオ・ディ・ジャンアントニオ２番手
気温２８度、路面温度４２度のドライコンディションの中、プラクティスで３番手に進出したファビオ・ディ・ジャンアントニオはフリープラクティス２で７番手、公式予選２は０.２１１秒差の２番手に入り、第４戦スペインＧＰ以来５戦ぶり４度目の１列目を獲得。
プラクティスで４番手だったフランチェスコ・バグナイアは０.２４４秒差の３番手に入り、第５戦フランスＧＰに続き今季２度目の１列目に進出。
マルク・マルケス５番手
プラクティス５番手のマルク・マルケスはフリープラクティス２で２番手に浮上したが、公式予選２は０.２９７秒差の５番手。プラクティス１７番手のフランコ・モルビデリは公式予選１を２番手で通過し、９番手まで挽回。プラクティス９番手のフェルミン・アルデグエルは１１番手。
マルコ・ベッツェッキ４番手
プラクティスで２番手に進出したマルコ・ベッツェッキは０.２８９秒差の４番手。『BMW M AWARD』で総合１位を維持すれば、ブルノ入りした水曜日から虫垂炎に苦しみ、手術を回避したいプラクティス１０番手のラウール・フェルナンデェスはフリープラクティス２で新品タイヤを履いて１番手に浮上すると、公式予選２は０.６３３秒差の７番手。
プラクティスで１１番手だったホルヘ・マルティンは第６戦カタルーニャＧＰに続き今季２度目の公式予選１で１番手、公式予選２は０.７７０秒差の１０番手。
ディオゴ・モレイラ予選最高位
プラクティスで８番手だったディオゴ・モレイラは０.５５２秒差の６番手。第７戦イタリアＧＰの８番手を上回る今季の予選最高位に進出し、プラクティス７番手のジョアン・ミルは１２番手。
プラクティス６番手のペドロ・アコスタは０.６８２秒差の８番手。
公式予選１
プラクティスで１２番手のマーベリック・ビニャーレスは０.２３４秒差の３番手。０.０３３秒差で昨年７月の第１１戦ドイツＧＰ以来となる公式予選２への進出を逃し、プラクティス１５番手のアレックス・マルケスは昨年９月の第１７戦日本ＧＰ以来今季初めての公式予選１で４番手。プラクティス１４番手のファビオ・クアルタラロは５番手だった。
ティソ・スプリント
周回数１０ラップのショートレース、ティソ・スプリントは６月２０日現地時間１５時００分、日本時間２２時００分スタート。