Stefano Nepa s’est fait un nom en Italie, au travers de catégories comme l’Europeo Minimto Junior A, l’Italiano Mini GP 50cc ou le pré-Moto3™ du CIV, qu’il ira jusqu’à remporter en 2014. En 2016, il s’attaque ensuite au Moto3™ du CIV, activité qu’il conjugue au FIM CEV Repsol Moto3™ l’espace de deux saisons. En 2018, il signe une cinquième place à Montmeló et dispute une wildcard au GP d’Italie, avant d’être appelé en renfort par le team CIP – Green Power pour pallier le départ de Makar Yurchenko. À Valence, il y inscrit ses premiers points. Sans guidon pour 2019, il repart pour une année en CEV, participe à une course avec le team Andres Perez 77 et récupère tout compte fait la place de Vicente Perez chez Reale Avintia Arizona 77, à qui il offrira deux Tops 10. Il en décrochera trois autres sous les couleurs cette fois du team Aspar, sans toutefois réaliser de progression significative. En 2021, il trouve alors refuge chez BOE Skull Rider Facile Energy, mais y connaîtra des prestations similaires. C’est pour le compte du team MTA qu’il officie en 2022, où il stagne une fois encore au général. L'année 2023 est légèrement mieux puisqu'il se classe 12e, mais il rétrograde au 13e rang en 2024. Recruté par SIC58 Squadra Corse pour 2025, l'Italien peut-il jouer autre chose que le ventre mou du Championnat ?