Sowohl in der 125ccm- als auch der 250ccm-Klasse kämpfte Elías um die Titel und stieg 2005 in die MotoGP auf. Im darauf folgenden Jahr holte seinen ersten Sieg er im Rennen in Estoril, einem der besten Rennen aller Zeiten, wo er gegen Valentino Rossi und Kenny Roberts Jr. triumphierte. 2008 wechselte er ins d’Antin Ducati Satelliten-Team und nach ein paar Podestplätzen kam Elías 2009 zurück zu San Carlo Honda Gresini, wo er die Saison auf dem siebten Platz beendete, seine bestes Gesamtergebnis in der Klasse. 2010 nahm er die Herausforderung Moto2 an, dominierte die neue Kategorie und holte sich den Titel - ein Ergebnis, dass ihm einen Platz in der MotoGP für 2011 einbrachte, diesmal am LCR Honda Team von Luccio Cecchinello. Doch die Saison erwies sich als äußerst schwierig für den Spanier, Rang 15 war nicht genug, um in der Königsklasse zu bleiben. 2012 kam er zurück in die Moto2 ins Aspar Team. Nachdem sich Fahrer und Team Mitte der Saison trennten, folgten ein paar Rennen im Pramac Team in der MotoGP™ als Ersatzfahrer für den verletzten Héctor Barberá, und später im Italtrans Racing Team in der Moto2. Im Jahr 2013 erhielt er einen Platz bei Blusens Avintia in der Moto2-Klasse. Elias wechselte dann in die Superbike Weltmeisterschaft, wo er nachd er Saison 2014 ohne Fahrerplatz da stand. 2015 sprang er in Indianapolis für den verletzten Karel Abraham ein, ab Aragon fuhr er die restliche Saison für das Forward Yamaha Racing Team.