Marcel Schrötter startete 2007 in der deutschen 125er-Nationalmeisterschaft, bevor er 2008 und 2009 hintereinander die Titel holte. In der Saison 2008 gab der Youngster sein Weltmeisterschaftsdebüt als Wildcard-Fahrer auf dem Sachsenring, bevor er 2009 drei weitere Einsätze absolvierte mit einem beeindruckenden fünften Platz in der Finnalrunde der Saison in Valencia. Nach seinem Debüt im Jahr 2010 wechselte Schrötter 2011 zum neu gegründeten Mahindra Racing Team, für das er fast anderthalb Jahre lang Rennen fuhr, zuerst in der 125er und dann in der Moto3™ -Weltmeisterschaft. Der Deutsche stieg dann in die Moto2 ™ auf und belegte 2014 den 10. Gesamtrang, bevor er 2016 nach einem Wechsel zum AGR-Team ein weiteres Jahr mit soliden Punkten und Top Ten-Plätzen erzielte. Für 2017 wechselte Schrötter in den Kader von Dynavolt Intact GP und erzielte einige solide Ergebnisse, bevor die zweite Saisonhälfte von Verletzungen beintrrächtigt war. Er blieb 2018 im Team und sicherte sich sein erstes Grand-Prix-Podium, indem er beim San Marino GP Dritter wurde. Seine dritte Saison mit Dynavolt Intact GP bgeann er im Jahr 2019 mit Podestplätzen beim Auftakt in Qatar und dann beim GP in Amerika, aber auch vor Heimpublikum auf dem Sachsenring errang er ein Podium. Weder in dieser Saison noch 2020 gelang es ihm, einen ersten Sieg für das Deutsche Team einzufahren. 2021 blieb er im gleichen Team doch auch in dieser Saison gelang es ihm nicht, einen Sieg zu erringen, stattdessen hatte er dauerhaft mit einem Formtief zu kämpfen. In seiner neunten Saison in der Zwischenklasse strebt Schrötter 2022 damit weiter seinen ersten Sieg an.