Mario Aji foi introduzido ao motocross pelo pai e começou a competir aos 10 anos, antes de migrar para as pistas de asfalto. Em 2018, o indonésio disputou a Idemitsu Asia Talent Cup, terminando na quinta posição com quatro pódios e uma vitória. No mesmo ano, também competiu no Asia Road Race Championship, na classe 250cc, onde finalizou em sexto lugar. Nas três temporadas seguintes, conciliou a Red Bull MotoGP™ Rookies Cup com o FIM CEV Repsol na Moto3™, mantendo-se de forma consistente entre os quinze primeiros colocados em ambos os campeonatos. Para 2022, a Honda Team Asia lhe concedeu uma vaga em tempo integral no Campeonato Mundial de Moto3™. O grande destaque de sua temporada de estreia foi o GP da Indonésia, em casa, onde conquistou um lugar na primeira fila do grid. Ao longo do ano, pontuou em duas ocasiões, desempenho suficiente para manter a confiança da equipe e garantir renovação para 2023. Posteriormente, foi promovido à Moto2™ para a temporada 2024. Em seu primeiro ano na categoria intermediária, Aji passou por um período de adaptação, tendo como melhor resultado um 15º lugar e somando quatro pontos ao longo da temporada. Em 2025, permaneceu com a IDEMITSU Honda Team Asia, mas enfrentou dificuldades após sofrer uma lesão no ombro no GP da Espanha. Retornou à ação na 15ª etapa, competiu nas provas restantes e encerrou o ano com um nono lugar no COTA como melhor resultado. Para 2026, Aji segue com a IDEMITSU Honda Team Asia, iniciando sua terceira temporada na Moto2™.