Stefano Manzi commence sa carrière en 2007 dans le cadre du Championnat d’Italie Minimoto Junior A. Deux ans plus tard, ce dernier rejoint le Championnat HIRP et remporte le titre MiniGP 2010. Il effectue alors un bref passage par la 70cc, puis intègre la Red Bull MotoGP Rookies Cup. Crédité du treizième rang lors de la campagne 2012, l’Italien termine troisième de cette coupe les deux saisons suivantes. Le transalpin débarque finalement en mondial début 2015 avec le team San Carlo Italia. Stefano Manzi y inscrit ses premiers points. En 2016, le natif de Rimini ne participe qu’à trois courses, mais se fait remarquer à Silverstone en s’adjugeant la quatrième place. Il fait également quelques apparitions en CEV Repsol Moto3™, avant de signer avec la structure Moto2™ du Sky Racing Team VR46 en 2017. Malheureusement, il ne figurera qu’une seule fois parmi les dix premiers. Même chose un an plus tard alors qu’il évolue cette fois pour le compte du Forward Racing Team. Contraint de manquer la fin de saison pour cause de blessure, il hérite ensuite d’une MV Agusta. Si les débuts sont compliqués, il remonte en flèche, avec trois Tops 10 sur les quatre dernières courses. Sa campagne 2021 ne sera toutefois pas fructueuse. En 2021, changement d’air, il rejoindra le Pons HP40.