Nato a Rimini, Stefano Manzi inizia la sua carriera ai massimi livelli nel 2015, dopo un primo anno di successi nelle categorie MiniGP e Mini MotoGP, oltre a una parentesi trascorsa nella Red Bull Rookies Cup. Debutta nel Campionato del mondo Moto3™ col San Carlo Team Italia in sella a una Mahindra al fianco di Matteo Ferrari, ottenendo sporadici punti e terminando la stagione 27°. Nel 2016 partecipa solo a tre Gran Premi come wildcard ma la sua performance al GP di Gran Bretagna è eccezionale: arriva 4°. Nel 2017 e il 2018, già in Moto2™, non sono anni facili. Prima è nello Sky Racing Team VR46 e poi passa al Forward Racing Team. Nel 2019 resta con la squadra italiana passando però al telaio MV Agusta. Termina l’anno stabilendo il proprio miglior risultato nel Mondiale: il 4° posto a Valencia. Anche il 2020 è stato un anno difficile ma si è tolto qualche soddisfazione come il nono posto al GP dell’Andalusia. Nel 2021 entra nelle file del Pons HP 40.