Jarno Janssen inizia la sua carriera sportiva dieci anni fa disputando gare di club della 50cc. Fa immediatamente progressi nel campionato olandese 125cc e continua fino a debuttare nel Motomondiale ad Assen nel 1996, mentre contemporaneamente prende parte al Campionato Europeo. Dopo essere passato alla 250 nel 1998, prende il via per il suo terzo Gran Premio in Olanda, come wildcard, e guadagna la possibilità di disputare l´intera stagione nel 1999. Dopo due stagioni piene di difficoltà, Jansen nel 2001 cerca di ravvivare la propria carriera ritornando al Campionato Europeo, che conclude in quarta posizione. Inoltre, colleziona punti nella 500 nel circuito di Le Mans dove sostituisce Haruchika Aoki, fermo a causa di una lesione.