Yonny Hernández empezó a competir en motocross a los 15 años y muy rápidamente se hizo popular en las competiciones nacionales. Fue campeón de Colombia de motocross 85 en 2003 y 2005, y subcampeón en 2004. Cuando llegó a España demostró unas cualidades que le acabaron abriendo las puertas del Campeonato del Mundo de Moto2™ en 2010, lo que le convirtió en el primer colombiano en correr en la escena mundialista. Tras dos temporadas en la categoría intermedia dio el salto a MotoGP™ pilotando una de las CRT del proyecto Avintia Racing. Durante los siguientes 4 años Yonny Hernández ocupó un lugar de la parrilla de la categoría reina siempre a lomos de una Ducati de algún equipo satélite. En 2017 volvió a Moto2™ con el equipo AGR tras 5 cursos en MotoGP™, pero no completó la temporada. La llamada del Team Pedercini Racing le abrió las puertas para competir en WorldSBK y afrontar un desafío inédito para él. Su amplia experiencia en el mundo del motociclismo le llevó a participar en 2019 en el Campeonato Mundial de Resistencia de la FIM con el equipo Honda Endurance Racing, donde finalizó 6º en la general. En 2021, el piloto colombiano afrontará una nueva etapa al recalar en la Copa del Mundo FIM Enel MotoE™ de la mano del OCTO Pramac MotoE.