ドゥカティ・モーター・ホールディングのレース部門、ドゥカティ・コルセは『MotoGP™』元年の２００２年６月にアウトードロモ・インテルナツィオナーレ・デル・ムジェロで開催された第５戦イタリアＧＰの際に２００３年からフル参戦することを発表。
デビュー戦となった２００３年４月の開幕戦日本ＧＰで、チャンピオンシップでの功績が讃えられ、ゼッケンナンバーが欠番となったロリス・カピロッシが初表彰台を獲得。第３戦スペインＧＰで初ポールポジション、そして、第６戦カタルーニャＧＰで初優勝を達成。
１勝を含む８度の表彰台を獲得して、コンストラクター部門で総合２位、チーム部門で総合３位に進出し、鮮烈なデビューシーズンを飾ったが、参戦２年目、３年目、４年目は１年目の成績を越えられなかったが、当時２１歳だったヤングライダーの起用が功を奏した。
ケーシー・ストーナー
参戦５年目の２００７年、ロリス・カピロッシのチームメイトとして、セテ・ジベルナウの後任に指名したのは、プレミアクラス１年目に全１７戦中完走した１０戦でシングルフィニッシュ、９戦でトップ６入りを果たし、総合８位に進出したケーシー・ストーナー。開幕戦カタールＧＰでデビューウィンを飾ると全１８戦中１０勝を含む１４度の表彰台を獲得。第１５戦日本ＧＰでタイトルを獲得しただけでなく、初めてコンストラクター部門とチーム部門も制して、三冠を達成。
ジャパニーズメーカー以外のバイクを駆けてライダー部門を制したのは、フィル・リードがＭＶアグスタを走らせた１９７４年以来３３年ぶり。コンストラクター部門では、ＭＶアグスタが最後にタイトルを獲得した１９７３年以来３４年ぶり。
経験豊富なトロイ・ベイリス、カルロス・チェカ、セテ・ジベルナウを引き継いだ新進気鋭の豪州人ライダーは、２０１０年まで所属した４年間で総合１位、２位、４位、４位に進出。全６７戦中２３勝を含む４２度の表彰台を獲得。ドゥカティの優勝ランキングにおいて、２３勝は第７戦イタリアＧＰが終了した時点で１位を維持。
ニッキー・ヘイデン
２００３年から６年間、ホンダのファクトリーチーム、レプソル・ホンダに所属し、２００６年にチャンピオンに輝いたニッキー・ヘイデンは、プロジェクトの中心的存在だったロリス・カピロッシの後任に指名されたマルコ・メランドリの後を受け継ぐ形で、２００９年からドゥカティのファクトリーチームに所属。ホンダ機から乗り換えた参戦１２戦目のインディアナポリスＧＰで初表彰台を獲得すると、５年間で全８６戦中３位３回の表彰台を獲得。
バレンティーノ・ロッシ
２０００年からホンダで３度、ヤマハで４度のタイトルを獲得した後、新たな挑戦を求め、２０１１年にドゥカティ入り。数々の成功をもたらしたケーシー・ストーナーが去った後、イタリアを象徴するバレンティーノ・ロッシ＆ドゥカティのコンビ結成に世界中が沸き、大きな期待が集まり、７年間乗り続けたヤマハ機から乗り換えた４戦目のフランスＧＰで初表彰台を獲得。在籍２年間で３５戦に出走して表彰台３回。ランキングは総合７位と６位だった。
アンドレア・ドビツィオーソ
２０１３年にバレンティーノ・ロッシの後任に指名される形でドゥカティ入り。ホンダ機からヤマハ機への素早い順応を見せた後だったが、初表彰台は所属２年目、２０戦目となった第２戦アメリカズＧＰ。３年目は開幕から連続して表彰台を獲得すると、７２戦目となった４年目の第１７戦マレーシアＧＰで初優勝を飾り、５年目の２０１７年から３年連続して総合２位を獲得。
ケーシー・ストーナーが去った後、低迷していた時期から脱出しただけでなく、特に２０１７年以降は優勝表彰台争い、タイトル争いの主役に定着。８年間で１４１戦に参戦して１４勝を含む４０度の表彰台を獲得した。
ホルヘ・ロレンソ
２００８年から９年間、ヤマハのファクトリーチームに所属して３度のタイトル獲得に成功した後、２０１４年にドゥカティ・コルセのジェネラルマネージャーに就任したジジ・ダリーニャの存在が影響したこともあり、２０１７年からドゥカティのファクトリーチームに所属すると、ヤマハ機からドゥカティ機に乗り換えた４戦目のスペインＧＰで初表彰台を獲得。
所属２年目、２４戦目となった第６戦イタリアＧＰで初優勝を挙げ、次戦の第７戦カタルーニャＧＰで連勝。デスモセディチＧＰに対して完全に適応し、本来のパフォーマンスを発揮していたが、第１４戦アラゴンＧＰの転倒が原因でその後の４戦を負傷欠場したことから、１年目の総合７位を上回ることができず、総合９位に後退。全３２戦中３勝を含む７度の表彰台を獲得。
フランチェスコ・バグナイア
２年間のサテライトチームを経て、２０２１年ファクトリーチームに昇格。ファクトリーチームのデビュー戦で２度目の表彰台を獲得。４２戦目となった第１３戦アラゴンＧＰで初優勝を挙げて勢いに乗り、総合２位に進出。
ファクトリーチーム２年目に歴史的な逆転劇を成功させて最終戦でチャンピオンに輝き、ドゥカティに２００７年のケーシー・ストーナー以来１５年ぶりとなるタイトル、そしてトリプルクラウンを達成。
ドゥカティ所属４年目、ファクトリーチーム所属２年目に史上初となる２連覇を成し遂げたこともあり、名実ともに絶対的なエースとして指名され、２０２４年シーズンの開幕前に契約を更新した。
マルク・マルケス
２０１３年から２０２３年まで１１年間で６度のタイトルを獲得、１６９戦で５９勝を含む１０１度の表彰台を獲得した後、ホンダのファクトリーチーム、レプソル・ホンダ・チームからドゥカティのサテライトチーム、グレシーニ・レーシングに移籍すると、ホンダ機から１年落ちのチャンピオンマシンに乗り換えて４戦目となったスペインＧＰで初表彰台を獲得。
２０２４年６月５日、ドゥカティから現王者フランチェスコ・バグナイアのチームメイトに指名されたことから、過去に５人のレジェンド（ストーナー/ヘイデン/ロッシ/ロレンソ/ドビツィオーソ）、４人のチャンピオン（ストーナー/ヘイデン/ロッシ/ロレンソ）が所属したファクトリーチーム入りが決定。
ニッキー・ヘイデンとバレンティーノ・ロッシは、ドゥカティ在籍期間に優勝を挙げられず、ホルヘ・ロレンソはヤマハ機から乗り換えて２４戦目で初優勝を果たしたことから、当然、シーズンのレベルとバイクの競争力など、単純に当時と比較することはできないが、マルク・マルケスが何戦目で初優勝を挙げられるか、そして、ファクトリーチームのデビュー戦、デビューシーズンでどのようなパフォーマンスを見せてくれるのか今から注目が集まる。
ファクトリーチームの歴代ラインナップ
２０２３年（２位/１位）
フランチェスコ・バグナイア（１位）/エネア・バスティアニーニ（１５位）
２０２２年（１位/１位）
ジャック・ミラー（５位）/フランチェスコ・バグナイア（１位）
２０２１年（１位/１位）
ジャック・ミラー（４位）/フランチェスコ・バグナイア（２位）
２０２０年（４位/１位）
アンドレア・ドビツィオーソ（４位）/ダニロ・ペトルッチ（１２位）
２０１９年（２位/３位）
アンドレア・ドビツィオーソ（２位）/ダニロ・ペトルッチ（６位）
２０１８年（２位/２位）
アンドレア・ドビツィオーソ（２位）/ホルヘ・ロレンソ（９位）
２０１７年（３位/３位）
アンドレア・ドビツィオーソ（２位）/ホルヘ・ロレンソ（７位）
２０１６年（３位/３位）
アンドレア・ドビツィオーソ（５位）/アンドレア・イアンノーネ（９位）
２０１５年（３位/３位）
アンドレア・ドビツィオーソ（７位）/アンドレア・イアンノーネ（５位）
２０１４年（３位/３位）
アンドレア・ドビツィオーソ（５位）/カル・クラッチロー（１３位）
２０１３年（４位/３位）
ニッキー・ヘイデン（９位）/アンドレア・ドビツィオーソ（８位）
２０１２年（４位/３位）
ニッキー・ヘイデン（９位）/バレンティーノ・ロッシ（６位）
２０１１年（３位/３位）
ニッキー・ヘイデン（８位）/バレンティーノ・ロッシ（７位）
２０１０年（３位/３位）
ケーシー・ストーナー（４位）/ニッキー・ヘイデン（７位）
２００９年（３位/３位）
ケーシー・ストーナー（４位）/ニッキー・ヘイデン（１３位）
２００８年（３位/２位）
ケーシー・ストーナー（２位）/マルコ・メランドリ（１７位）
２００７年（１位/１位）
ロリス・カピロッシ（７位）/ケーシー・ストーナー（１位）
２００６年（３位/３位）
ロリス・カピロッシ（３位）/セテ・ジベルナウ（１３位）
２００５年（４位/３位）
ロリス・カピロッシ（６位）/カルロス・チェカ（９位）
２００４年（５位/３位）
ロリス・カピロッシ（９位）/トロイ・ベイリス（１４位）
２００３年（３位/２位）
ロリス・カピロッシ（４位）/トロイ・ベイリス（６位）