Iker Lecuona debutó en el Campeonato del Mundo de Moto2™ en 2016 con la edad mínima permitida, 16 años. Debido a la lesión de Dominique Aegerter, el equipo Garage Plus Interwetten apostó por él para disputar las últimas carreras del año. Tras una temporada plagada de caídas y lesiones en 2017, el curso 2018 le sirvió para consolidarse como uno de los pilotos de futuro de la categoría intermedia del Campeonato del Mundo, coronando el año con una segunda plaza en la última carrera disputada en Valencia. En 2019, enrolado en el American Racing, Iker partió como uno de los valores a seguir. Tras ser 4º en Argentina en el segundo GP del año, encadenó varios Top 10 antes de subir al podio en Tailandia.
La salida de Johann Zarco de KTM y el devenir del mercado propició su salto a la categoría reina en 2020, teniendo la oportunidad de debutar de forma anticipada en la última cita de 2019 disputada en Valencia para suplir al lesionado Miguel Oliveira, su futuro compañero de equipo en Red Bull KTM Tech3. Su año como rookie sería complicado, marcado por varios abandonos iniciales y ausencias vinculadas a la COVID-19 en el tramo final del año. Pese a ello, varios Top 10 marcarían la línea a seguir en 2021, antes de aterrizar en WorldSBK. En el Gran Premio de España de 2023, Iker Lecuona regresaría a la parrilla de MotoGP para sustituir al lesionado Marc Márquez en el Repsol Honda. Tras su fichaje por Ducati en WorldSBK, Lecuona volvería a ser llamado al paddock de MotoGP para el Gran Premio de Hungría 2026 para reemplazar a Álex Márquez en el BK8 Gresini Racing MotoGP. Su séptima posición el domingo causaría una gran impresión, lo que llevaría a que posteriormente fuera convocado de nuevo para sustituir a Fermín Aldeguer en Silverstone.